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    王晓课题组揭示N9嘌呤核苷的前生物合成新途径

    发布时间:2021-05-10 点击次数: 作者:化学化工学院 来源:科学技术处

    在生命起源研究中,“RNA世界”(RNA World)是目前影响最大的假说之一,即在生命出现之前,原始RNA可同时作为催化剂和遗传物质。原始RNA的前生物合成(Prebiotic Synthesis)包括核糖的形成、碱基的合成、糖苷键的生成、磷酸化以及核苷酸的聚合。在所有步骤中,糖苷键的生成是一个近50年来悬而未决的大难题。它的挑战在于,对于嘌呤核苷,所有经典的糖-碱基缩合条件都无法选择性地生成N9核苷,因N9位的亲核性远弱于腺嘌呤的6-氨基或鸟嘌呤的2-氨基。

    意大利化学家Saladino和Di Mauro于2015年报道了质子辐照引发的自由基糖苷化,得到了数量较多的N9嘌呤核苷。然而,质子辐照在原始地球上是否具有普遍性尚未被证实。如存在更普适的、能够引发自由基的自然条件,则嘌呤核苷的N9选择性问题将会得到合理的解释。空化(Cavitation)是液体内局部压力降低时,空泡形成并随即溃灭的现象。在溃灭的瞬间,最高可产生5000 K的高温和500 atm的高压,足以引发水分子的均裂,生成H和OH自由基。在水高速流经尖锐物体时,如受到较大剪切力的作用,即可发生空化。这在自然界非常普遍,如瀑布、降雨、海浪冲击礁石等(图1)。

    图1. 原始地球上可能引发空化效应的场景

    近期,王晓课题组深入研究了嘌呤类核苷的前生物合成,发现了空化效应对于嘌呤糖苷化N9选择性的促进作用。这项工作首先通过测定不同功率超声作用下的N9核苷总产率、6-amino产物总产率以及两者比值,揭示了空化强度对产物分布的影响(图2)。机理研究方面,借助羟基自由基荧光探针TA,证明了空化作用下OH自由基的存在,并通过对比实验证实了糖苷化的自由基机理。此外,还模拟了原始地球的季节性干湿循环。在超声的作用下,一个干湿循环后的N9/6-amino比值已高达0.45;如此高的产物比例尚属首次报道。

    图2. 不用空化强度对N9嘌呤核苷产率的影响(红:无超声;蓝:800W超声池;绿:1000W超声振子)

    为探索更为普适的前生物合成条件,王晓团队借助连续流化学技术和微反应器,模拟水力空化(Hydrodynamic Cavitation)作用下空泡的形成和溃灭,同样观测到了N9产率的提高。水力空化效应虽然不及超声显著,但通过长年累月的不断作用,依然会相当可观(图3)。这项研究对于生命起源的意义在于,它首次证明了N9嘌呤核苷可以在一类普遍而不太苛刻的自然条件下形成并富集。同时,它也是一个以水分子作为“催化剂”的反应,为实现绿色糖苷化提供了新思路。

    图3. 借助连续流技术和微反应器模拟水力空化作用

    该成果以“Cavitation as a Plausible Driving Force for the Prebiotic Formation of N9 Purine Nucleosides”为题发表于Cell子刊Cell Reports Physical Science2021, 2, 100375;https://www.cell.com/cell-reports-physical-science/fulltext/S2666-3864(21)00065-5)。王晓副教授为本文通讯作者,研究助理叶尔森•帕特合别克、2020级博士研究生赵泽润、2017级硕士研究生王苏为并列第一作者。团队特别感谢37000cm威尼斯化学化工学院张志炳教授在空化效应方面的建议和指导,同时感谢诺贝尔生理学或医学奖得主、哈佛大学医学院Jack Szostak教授在RNA World假说方面的建议和帮助,感谢以色列本古里安大学Yehuda Zeiri教授在空化作用理论计算方面的建议。